Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP2O75604 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP2O75604 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP2O75604 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP2O75604 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP2O75604 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP2O75604 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP2O75604 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP2O75604 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP2O75604 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP2O75604 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP2O75604 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP2O75604 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP2O75604 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP2O75604 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP2O75604 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP2O75604 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP2O75604 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP2O75604 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
USP2O75604 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP2O75604 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP2O75604 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP2O75604 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP2O75604 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP2O75604 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP2O75604 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP2O75604 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP2O75604 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
USP2O75604 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP2O75604 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP2O75604 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP2O75604 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP2O75604 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP2O75604 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
USP2O75604 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP2O75604 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP2O75604 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP2O75604 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP2O75604 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP2O75604 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP2O75604 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP2O75604 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP2O75604 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP2O75604 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP2O75604 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP2O75604 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
USP2O75604 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP2O75604 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP2O75604 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP2O75604 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP2O75604 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP2O75604 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP2O75604 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP2O75604 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP2O75604 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP2O75604 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP2O75604 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP2O75604 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP2O75604 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP2O75604 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP2O75604 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP2O75604 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP2O75604 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP2O75604 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP2O75604 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP2O75604 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP2O75604 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
USP2O75604 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
USP2O75604 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP2O75604 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP2O75604 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP2O75604 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP2O75604 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP2O75604 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP2O75604 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP2O75604 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
USP2O75604 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP2O75604 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP2O75604 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP2O75604 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP2O75604 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP2O75604 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP2O75604 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP2O75604 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP2O75604 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP2O75604 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP2O75604 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP2O75604 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP2O75604 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP2O75604 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP2O75604 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP2O75604 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP2O75604 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP2O75604 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP2O75604 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP2O75604 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP2O75604 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP2O75604 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP2O75604 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP2O75604 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms