Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC4O75487 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC4O75487 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC4O75487 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC4O75487 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC4O75487 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC4O75487 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC4O75487 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC4O75487 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC4O75487 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC4O75487 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC4O75487 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC4O75487 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC4O75487 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC4O75487 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC4O75487 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC4O75487 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC4O75487 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC4O75487 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC4O75487 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC4O75487 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC4O75487 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC4O75487 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC4O75487 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC4O75487 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC4O75487 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC4O75487 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC4O75487 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC4O75487 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC4O75487 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC4O75487 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC4O75487 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC4O75487 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC4O75487 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC4O75487 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC4O75487 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC4O75487 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC4O75487 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC4O75487 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC4O75487 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC4O75487 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC4O75487 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC4O75487 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC4O75487 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC4O75487 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC4O75487 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC4O75487 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC4O75487 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC4O75487 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC4O75487 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC4O75487 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC4O75487 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC4O75487 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC4O75487 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC4O75487 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC4O75487 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC4O75487 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC4O75487 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC4O75487 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC4O75487 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC4O75487 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC4O75487 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC4O75487 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC4O75487 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC4O75487 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC4O75487 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC4O75487 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC4O75487 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC4O75487 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC4O75487 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC4O75487 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC4O75487 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC4O75487 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC4O75487 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC4O75487 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC4O75487 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC4O75487 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC4O75487 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC4O75487 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC4O75487 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC4O75487 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC4O75487 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC4O75487 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC4O75487 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC4O75487 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC4O75487 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC4O75487 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC4O75487 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC4O75487 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC4O75487 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC4O75487 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC4O75487 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC4O75487 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC4O75487 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC4O75487 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC4O75487 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC4O75487 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC4O75487 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC4O75487 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC4O75487 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms