Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX11AO75192 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX11AO75192 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX11AO75192 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX11AO75192 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX11AO75192 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX11AO75192 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX11AO75192 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX11AO75192 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX11AO75192 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX11AO75192 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11AO75192 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PEX11AO75192 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PEX11AO75192 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11AO75192 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11AO75192 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11AO75192 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms