Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF10O60809 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF10O60809 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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