Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NOBOXO60393 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOBOXO60393 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms