Protein–RNA interactions for Protein: O60237

PPP1R12B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R12BO60237 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R12BO60237 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R12BO60237 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R12BO60237 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPP1R12BO60237 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R12BO60237 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R12BO60237 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R12BO60237 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R12BO60237 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R12BO60237 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R12BO60237 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R12BO60237 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R12BO60237 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R12BO60237 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R12BO60237 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R12BO60237 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms