Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASA4O43374 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASA4O43374 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASA4O43374 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASA4O43374 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RASA4O43374 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RASA4O43374 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RASA4O43374 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RASA4O43374 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASA4O43374 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RASA4O43374 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASA4O43374 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASA4O43374 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASA4O43374 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASA4O43374 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASA4O43374 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASA4O43374 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASA4O43374 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASA4O43374 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASA4O43374 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASA4O43374 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASA4O43374 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASA4O43374 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASA4O43374 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASA4O43374 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASA4O43374 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RASA4O43374 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RASA4O43374 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RASA4O43374 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASA4O43374 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASA4O43374 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASA4O43374 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASA4O43374 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASA4O43374 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASA4O43374 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASA4O43374 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASA4O43374 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms