Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN5O00501 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN5O00501 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms