Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MEIS1O00470 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MEIS1O00470 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MEIS1O00470 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms