Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGRNO00468 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGRNO00468 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGRNO00468 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGRNO00468 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGRNO00468 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGRNO00468 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGRNO00468 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGRNO00468 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGRNO00468 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGRNO00468 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGRNO00468 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AGRNO00468 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGRNO00468 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGRNO00468 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGRNO00468 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGRNO00468 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGRNO00468 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGRNO00468 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGRNO00468 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGRNO00468 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGRNO00468 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGRNO00468 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGRNO00468 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGRNO00468 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGRNO00468 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRNO00468 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRNO00468 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRNO00468 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRNO00468 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRNO00468 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRNO00468 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRNO00468 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRNO00468 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRNO00468 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRNO00468 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRNO00468 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRNO00468 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRNO00468 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRNO00468 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRNO00468 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRNO00468 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRNO00468 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRNO00468 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRNO00468 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRNO00468 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRNO00468 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRNO00468 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRNO00468 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRNO00468 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRNO00468 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRNO00468 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRNO00468 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRNO00468 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRNO00468 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRNO00468 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRNO00468 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRNO00468 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRNO00468 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRNO00468 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRNO00468 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRNO00468 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRNO00468 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRNO00468 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRNO00468 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRNO00468 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGRNO00468 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGRNO00468 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGRNO00468 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AGRNO00468 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AGRNO00468 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AGRNO00468 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AGRNO00468 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AGRNO00468 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AGRNO00468 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AGRNO00468 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AGRNO00468 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AGRNO00468 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AGRNO00468 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AGRNO00468 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AGRNO00468 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AGRNO00468 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AGRNO00468 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AGRNO00468 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AGRNO00468 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AGRNO00468 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
AGRNO00468 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AGRNO00468 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AGRNO00468 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AGRNO00468 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AGRNO00468 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AGRNO00468 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AGRNO00468 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AGRNO00468 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AGRNO00468 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AGRNO00468 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AGRNO00468 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AGRNO00468 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AGRNO00468 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AGRNO00468 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms