Protein–RNA interactions for Protein: M0QZD8

LOC400499, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOC400499M0QZD8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LOC400499M0QZD8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LOC400499M0QZD8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LOC400499M0QZD8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LOC400499M0QZD8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LOC400499M0QZD8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LOC400499M0QZD8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LOC400499M0QZD8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LOC400499M0QZD8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LOC400499M0QZD8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOC400499M0QZD8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LOC400499M0QZD8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOC400499M0QZD8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOC400499M0QZD8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOC400499M0QZD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOC400499M0QZD8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOC400499M0QZD8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOC400499M0QZD8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOC400499M0QZD8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOC400499M0QZD8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOC400499M0QZD8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOC400499M0QZD8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LOC400499M0QZD8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LOC400499M0QZD8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOC400499M0QZD8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms