Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
H7C1D1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
H7C1D1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
H7C1D1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H7C1D1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
H7C1D1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H7C1D1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H7C1D1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
H7C1D1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
H7C1D1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
H7C1D1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
H7C1D1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
H7C1D1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
H7C1D1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
H7C1D1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
H7C1D1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
H7C1D1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
H7C1D1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
H7C1D1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
H7C1D1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
H7C1D1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
H7C1D1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
H7C1D1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
H7C1D1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
H7C1D1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
H7C1D1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
H7C1D1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
H7C1D1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
H7C1D1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
H7C1D1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1D1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1D1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1D1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1D1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1D1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1D1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1D1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1D1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
H7C1D1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
H7C1D1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
H7C1D1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
H7C1D1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
H7C1D1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
H7C1D1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
H7C1D1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1D1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1D1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1D1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1D1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1D1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1D1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1D1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1D1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1D1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1D1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
H7C1D1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
H7C1D1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
H7C1D1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
H7C1D1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
H7C1D1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
H7C1D1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
H7C1D1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
H7C1D1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
H7C1D1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
H7C1D1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
H7C1D1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
H7C1D1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
H7C1D1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
H7C1D1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
H7C1D1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
H7C1D1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
H7C1D1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
H7C1D1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
H7C1D1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
H7C1D1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
H7C1D1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
H7C1D1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
H7C1D1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
H7C1D1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
H7C1D1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
H7C1D1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
H7C1D1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
H7C1D1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
H7C1D1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
H7C1D1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
H7C1D1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
H7C1D1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
H7C1D1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
H7C1D1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
H7C1D1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
H7C1D1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
H7C1D1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
H7C1D1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
H7C1D1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
H7C1D1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
H7C1D1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
H7C1D1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
H7C1D1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
H7C1D1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
H7C1D1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms