Protein–RNA interactions for Protein: A6NNN8

SLC38A8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A8A6NNN8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC38A8A6NNN8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC38A8A6NNN8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC38A8A6NNN8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC38A8A6NNN8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A8A6NNN8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A8A6NNN8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A8A6NNN8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A8A6NNN8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A8A6NNN8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A8A6NNN8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms