Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms