Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARF3P61204 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARF3P61204 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF3P61204 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms