Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTAP01040 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTAP01040 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTAP01040 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms