Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BROXQ5VW32 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms