Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL1P40616 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL1P40616 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms