Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FDFT1P37268 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms