Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms