Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKAP2O75563 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms