Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3GL3Q99963 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms