Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTPAP49638 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTPAP49638 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms