Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGM1P36871 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGM1P36871 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGM1P36871 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGM1P36871 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGM1P36871 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGM1P36871 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGM1P36871 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGM1P36871 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGM1P36871 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGM1P36871 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGM1P36871 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGM1P36871 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGM1P36871 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGM1P36871 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGM1P36871 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGM1P36871 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGM1P36871 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGM1P36871 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms