Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB31Q13636 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms