Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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