Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPD1P21695 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPD1P21695 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPD1P21695 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms