Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OIP5O43482 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OIP5O43482 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OIP5O43482 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OIP5O43482 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OIP5O43482 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OIP5O43482 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OIP5O43482 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OIP5O43482 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OIP5O43482 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OIP5O43482 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OIP5O43482 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OIP5O43482 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OIP5O43482 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OIP5O43482 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OIP5O43482 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OIP5O43482 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms