Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DHX29Q7Z478 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DHX29Q7Z478 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DHX29Q7Z478 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX29Q7Z478 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms