Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms