Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms