Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms