Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms