Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms