Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms