Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HBBP68871 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HBBP68871 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms