Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TTPAP49638 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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