Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.75e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DOCK9-214ENST00000479769 420 ntTSL 319.4■□□□□ 0.75e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DMTN-222ENST00000523623 581 ntTSL 319.37■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 LMNA-211ENST00000470199 551 ntTSL 419.36■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 FAM193B-209ENST00000507212 717 ntTSL 219.35■□□□□ 0.698e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 XRRA1-220ENST00000534798 568 ntTSL 419.18■□□□□ 0.664e-11■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ARRB1-210ENST00000532525 925 ntTSL 519.16■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.655e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.645e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DMTN-208ENST00000517418 977 ntTSL 219.06■□□□□ 0.644e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DCAF15-202ENST00000585468 815 ntTSL 218.99■□□□□ 0.635e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.635e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PUF60-214ENST00000529693 684 ntTSL 218.79■□□□□ 0.68e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ATL2-211ENST00000456736 578 ntTSL 318.78■□□□□ 0.61e-8■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DMTN-216ENST00000520174 1057 ntTSL 518.71■□□□□ 0.594e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.586e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DMTN-213ENST00000519850 587 ntTSL 418.64■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.578e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 HDAC5-210ENST00000591714 667 ntTSL 318.42■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 FAM193B-204ENST00000505569 1870 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.518e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 LSM14A-208ENST00000590416 699 ntTSL 218.21■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 FERMT3-207ENST00000544997 1006 ntTSL 318.11■□□□□ 0.498e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 XRRA1-210ENST00000529400 561 ntTSL 418.03■□□□□ 0.484e-11■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 LMNA-219ENST00000502751 570 ntTSL 418.02■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ATL2-212ENST00000472097 561 ntTSL 317.99■□□□□ 0.471e-8■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ATL2-205ENST00000416222 593 ntTSL 417.99■□□□□ 0.471e-8■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ALKBH6-215ENST00000490986 977 ntTSL 1 (best)17.98■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ALKBH6-214ENST00000490483 861 ntTSL 517.98■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 FERMT3-205ENST00000541252 714 ntTSL 317.93■□□□□ 0.468e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DMTN-221ENST00000523300 601 ntTSL 417.84■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PTGES2-205ENST00000476655 1063 ntTSL 317.8■□□□□ 0.445e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.448e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DMTN-210ENST00000517804 813 ntTSL 517.79■□□□□ 0.444e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DMTN-215ENST00000519959 578 ntTSL 417.77■□□□□ 0.444e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ARHGAP17-211ENST00000573449 574 ntTSL 317.72■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.395e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DGKQ-202ENST00000502309 818 ntTSL 517.48■□□□□ 0.395e-8■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ZCCHC9-207ENST00000506458 818 ntTSL 217.48■□□□□ 0.398e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 MMS19-213ENST00000448660 776 ntTSL 517.45■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 RALGPS2-209ENST00000495034 1970 ntTSL 217.39■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.375e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ATL2-208ENST00000449130 526 ntTSL 317.3■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PUF60-205ENST00000524570 1934 ntTSL 217.21■□□□□ 0.358e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.335e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.325e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 NAGK-203ENST00000428360 488 ntTSL 517.03■□□□□ 0.325e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.295e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 SNUPN-210ENST00000568162 759 ntTSL 316.81■□□□□ 0.284e-11■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.266e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PCSK4-202ENST00000441747 2641 ntTSL 216.64■□□□□ 0.255e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PCSK4-210ENST00000591201 2358 ntTSL 516.47■□□□□ 0.235e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 RBM4-209ENST00000515838 943 ntTSL 216.46■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PUF60-212ENST00000528320 922 ntTSL 216.44■□□□□ 0.228e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.225e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 SLC43A2-203ENST00000571376 623 ntTSL 316.4■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PUF60-207ENST00000526459 1003 ntTSL 216.35■□□□□ 0.218e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ANP32A-201ENST00000267918 1084 ntTSL 316.33■□□□□ 0.25e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PUF60-221ENST00000533162 761 ntTSL 316.26■□□□□ 0.198e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 FAM193B-215ENST00000513282 651 ntTSL 316.26■□□□□ 0.198e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.198e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.185e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-12■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 SCRN2-203ENST00000578323 624 ntTSL 516.01■□□□□ 0.156e-8■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ATP2A3-207ENST00000570773 989 ntTSL 215.86■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 CTAGE5-216ENST00000556990 568 ntTSL 415.83■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 MICAL3-213ENST00000577821 807 ntTSL 315.68■□□□□ 0.15e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 XRRA1-204ENST00000524430 561 ntTSL 415.68■□□□□ 0.14e-11■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.15e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 FAM193B-202ENST00000504130 394 ntTSL 515.43■□□□□ 0.068e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PUF60-215ENST00000529999 867 ntTSL 315.35■□□□□ 0.058e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ATL2-209ENST00000451483 576 ntTSL 415.26■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DMTN-217ENST00000520856 589 ntTSL 315.24■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ARRB1-203ENST00000524400 593 ntTSL 415.03■□□□□ -05e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 TCOF1-215ENST00000515516 661 ntTSL 515.03■□□□□ -06e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.018e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DIABLO-202ENST00000342392 1336 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 SDCBP2-AS1-203ENST00000609285 561 ntTSL 414.97□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 VILL-209ENST00000486616 4439 ntTSL 214.96□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.026e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.028e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 CDK9-204ENST00000491521 510 ntTSL 314.84□□□□□ -0.038e-14■■■■■ 114.9
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1170.9 ms