Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms