Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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