Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms