Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms