Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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