Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms