Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD47Q08722 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD47Q08722 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD47Q08722 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms