Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms