Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms