Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EBF4Q9BQW3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBF4Q9BQW3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EBF4Q9BQW3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms