Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms