Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms